深圳市国土资源局是市政府领导下的行政执法机构，是市政府的直属单位，下设行政处、司法处、资源科学处、基本农田保护处、环保科学处和办公室等7个内设机构，全市共有8个分局和41个所级机构，是深圳市土地、矿产、地质、用海、海洋、测绘等资源管理的主管部门，主要职责是配合市政府实施国土资源管理政策，加强土地资源的统筹规划和利用，保障国家土地资源安全与经济社会可持续发展。
深圳市国土局的主要任务是：负责土地、矿产、地质、用海、海洋、测绘等资源的规划、管理、监督、评估和综合利用；负责研究、制定和落实土地、矿产、地质、用海、海洋、测绘等资源管理政策，发展和完善土地、矿产、地质、用海、海洋、测绘等资源管理制度和法规；负责社会稳定风险评估、建议和监测、应急处置等工作；参与国有建设用地的划拨、出让，土地使用权的规划、调整、登记、核准等工作。